Специальный агент ЦРУ Итан Хант решил навсегда покончить с оперативной работой, остепениться и посвятить остаток жизни тренировке новобранцев для ЦРУ. Однако у начальства на него совсем другие планы: Итана просят принять участие в последней миссии, выполнить которую снова под силу лишь ему.
В фильме «Миссия невыполнима 3» суперагент Итан Хант решил жениться на докторе Джулии и уйти с поста главы отдела ЦРУ по подготовке курсантов.
Однако во время помолвки с Хантом связывается руководство и просит его принять участие в последней операции по спасению его бывшей ученицы Линдси Феррис.
Выясняется, что Линдси оказалась в заложниках у торговца оружием Оуэна Дэвиана.