После спасения своих родителей и всего мира от заговора коварного Миньона, Джун и Кармен были приняты в Организацию Супершпионов в качестве полноправных секретных агентов. Они набрались опыта, получили новую крутую экипировку, но и задания стали гораздо сложнее. Не говоря уж о том, что у них появились конкуренты в лице детей нового директора Организации Супершпионов - Гэри и Герти Гигглзов.
Продолжение истории про секретных агентов в фильме «Дети шпионов 2: Остров несбывшихся надежд» представляет подросших детей Кортесов.
Кармен и Джуни становятся агентами Организации Супершпионов.
Брат и сестра набрались опыта, получили новую крутую экипировку, и задания, которые оказались гораздо сложнее.